比对搜索工具 BASIC local alignment search tool, BLAST
一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具,它的产生是基于Altschul等人1990年在J.Mol.Biol.上发表的论文。
BLAST程序能将某个DNA或蛋白质序列与已知的生物序列数据库中的序列进行快速相似性比对。BLAST计算结果中的得分是对序列相似性程度的一种度量。BLAST采用一种局部算法可以获得两个序列中具有相似性的序列片段,它基于匹配短序列片段,利用随机过程中的似然分析来确定未知序列与数据库序列的最佳局部联配。
BLAST可以下载公共数据库,用于本地查询。也可以通过Internet直接到网上查询(即netblast)。提交待查序列的方法有3种: 用E-mail、委托程序或WWW界面提交序列。三种方法均由 ...... (共756字) [阅读本文]>>